Я жил очень долго в Дании, в связи с чем получилось, что язык родной русский а раскладка стала родной сперва датская, а потом англиская.
6 лет писал в транслите, пока не заставили писать русскими буквами,
и я написал программу-транслитератор, который преобразовывает транслит "на лету".
Печатая (нажимая на клавиши) "translit, koshechka" видно на экране "транслит, кошечка".
(вот это сообщение я тоже пишу в транслите, как и весь русский текст, по многу часов в день)
Я, как автор программы CrazyKeys, заинтересован её улучшать и не заброшу её,
поэтому мне можно ( в ICQ 2 0 0 4 0 6 6 0 6 ) писать любые мои недочеты и коментарии,
хотя я тестирую программу каждый день в раскладках английской и иногда датской.
(программа работает с любой раскладкой)
Если у Вас 3 языка на компьютере или более, то на сайте, как и в помощи, подробно написано как её настроить.
(ПС программа стандартные настройки windows не ломает, и не работает на поломанных файлах windows связанных с языками)
сайт программы находится тут:
http://www.lioan.narod.ru/CrazyKeysHomepage/CrazyKeys.htm
хотя это и не совсем реклама, т.к. CrazyKeys всегда будет бесплатна на благо в первую очередь русским,
я пойму модераторов форума если они этот пост удалят.
Спасибо всем, жду отзывов, не только в ICQ, но и тут на форуме.

это правилами можно задать как угодно, можно добавлять правила вида "sps" -> "спасибо" извинете, не так оформил хех, за 10 лет мне удалось только английскую освоить, и то с трудом, хотя за компьютером провожу более 8 часов в день. если видишь такой транслит как текст то да, а если видишь нормальные русские буквы, то нет.
Например, я ненавижу читать транслит, хотя прямо сейчас пишу в транслите, но я вижу именно русские буквы в окне.

в программе редактор правил, которые можно менять добавлять и удалять.
правила имеют вид [исходная последовательность клавишь] => [последовательность которая должна появиться]
чисто английскую раскладку я не беру, если у вас ишодный язык например чешский то по умолчанию программа предлагает для буквы "ш" нажатие клавишы "š", хотя это можно изменить правилами. Различия с фонетической (которую вы предложили) в том что:
1а) одно нажатие - одна буква, т.е. я не могу писать "ё" нажимая 2 или более клавишь "jo" и "yo"
1б) а также нажимая "x" не могу получять "кс"
2) не возможно ей пользоваться на компьютере под логином например "guest", т.к. для начала требует завести редактор, а потом установить раскладку.
3) очень нудный редактор правил, и переключаться на раскладку не одним лёгким нажатием одной кнопки.
а так, больше отличий я не нашёл, ну ещё она конечно 10Мб.

если бы проблемы транслита не существовало бы, то "транслит.ру" не был бы таким популярным сайтом.