WAKE-UP<...>
Если у кого-то был опыт разработки ТЗ и внедрения Евфрат на предприятии формата — 9 отделов и 50-60 пользователей — подскажите, в какую сумму выливается разработка ТЗ, конфигурирование и внедрение. Цены можно указать Московские (без ссылки что на периферии "дешевле").
Буду благодарен за помощь и уточнения.
К сожалению, именно такого опыта нет. Но IMHO чужие оценки вам вряд ли помогут - всё очень сильно зависит от вашей команды, отношений с заказчиком, мотивации его сотрудников. Сделайте пилот - 3 "маршрута" в двух отделах, аппроксимируйте на 9x28, учтите риски, желаемую прибыльность, платёжеспособность заказчика, и выставляйте ценник. Не согласятся - списывайте затраты пилотирования на пресейл.

По платёжеспособности - IMHO вряд ли согласятся платить больше, чем на $500 на пользователя. Вот и думайте, браться ли, если за каждый "маршрут" заплатят $100, включая маржу, работу, управление, железо и лицензии.

ЮВИмхо, вы путаете ТЗ (техническое задание), которое по ГОСТам должен (формально !) готовить Заказчик (т. е. вы не несете никаких затрат), и в котором он формулирует свою цель выполненя работы и требования, которые должны быть реализованы в конечном итоге, и собственно ТП (технический проект), в котором вы, как разработчик, приводите конкретные технические решения по достижению поставленных целей.

WAKE-UPЦель: внедрение СЭД в торговом предприятии
Это не цель. Это назначение вашей работы.

Цель - это конкретные экономические или иные показатели (качественные, социальные и т. п.) которые могут (и даже должны!) быть достигнуты в результате внедрения вашей СЭД, чтобы окупить понесенные Заказчиком затраты.
Если внедрение (даже успешное) не приносит выгоды, то внедрение просто ради внедрения не имеет особого смысла.
Исполнителю важно экономическое обоснование заказчика ровно постольку, поскольку влияет на платёжеспособность заказчика. Если заказчик решит внедрить систему, от которой будет терпеть огромные убытки - исполнитель должен осуществить внедрение качественно, в срок, надёжно прикрывшись договором и ТЗ, по которым ему, исполнителю, не имеют права не заплатить за уже осуществлённую часть внедрения. Это обычные товарно-денежные отношения.

Если в договоре с исполнителем написано, что он получает деньги за внедрение СЭД, то его цель - внедрение СЭД, а вовсе не за достижение финансовых показателей. В таком случае, достижение заказчиком финансовых показателей - вопрос репутации, имиджа и PR, но не прибыли исполнителя.