Serguei-Появился 2й потенциальный заказчик и он желает получить некоторый функционал для себя, но на всю систему хочет исключительные права(включая базовые ""кубики")
Такие желания обычно появляются в результате двух фактов:

1. Люди не особо разбираются и не хотят думать
2. Бери как можно больше, поскольку бесплатно.

Если он хочет исключительные права - надо разобраться, зачем. Но вероятность 99%, что это желание исчезнет и сменится более разумным, как только он услышит, что это стоит существенных дополнительных денег.

SergueiУ меня возникла мысль сделать 2 договора: 1. "внедрение базовых кубиков" с неисключительными правами 2. Разработка доп функционала для заказчика (исключительные права)
В целом правильно. Дальше вполне логично будет оформить систему как семейство продуктов: ядро, дополнительные модули, всё покупается отдельно. По желанию заказчику разрабатываются доп.модули. По желанию он их разрабатывает сам. Стоит продумать два вопроса:

1. Что делать, если заказчик хочет интересный кубик, от которого и вы не отказались бы. Во многих отношениях лучше сделать ему этот кубик, а потом на основании полученного опыта сделать универсальный, но заказчик может обидеться.

2. Как увернуться от ситуации, когда заказчик сначала сделал свой модуль или модифицировал ваш, а теперь хочет, чтобы вы ему всё исправили.