assei,

В режиме Append сделать будет очень сложно. Читайте весь файл целиком в режиме Input в переменную.
После чтения прогоняем переменную через Split() получаем массив строк.

Выполняем в цикл от 1 до N строк перебор, для каждой строки ищем через Instr() вхождение ; и если оно отсутствует - значит первый столбец заполнен, а второй отсутствует. Если он присутствует в 1 позиции значит - первый столбец пустой, а второй заполнен.

Лепим новую строку и записываем в выходной файл.


Текущий код надо выкинуть, что-то в него дописывать трудозатратно