Здравствуйте, проверил весь цикл, всё оказывается рабочим кроме заполнения конечного массива, при записи в массив ограничивается двумерный массив значениями i = 0 ,а j проходит полностью.

Да размеры норм выводит. Уже разобрался с вопросом.Всем спасибо.

Вышло вот так: Как я понимаю new Color(image.getRGB(j, i)) требует только массива типа Color и не получалось записать значения в массив типа int, и понятно т.к. он выводит 3 значения r g b, а вот когда мы выполняем метод и берём какой-то конкретный метод цвета, то уже значение получается типа int. Только вот не совсем понимаю перестановку значений пробегающих по циклу в строке result[i][j] = new Color(image.getRGB(j, i)); Если в getRGB(j, i) не менять переменные цикла, то всё равно не хочет работать, а так, что очень странно работает на весь цикл шириной и длиной изображения. Да и вроде не выводится один и тот-же цикл (Проверял значения со сменой переменных цикла).

import java.awt.Color;
import java.awt.Image;
import java.awt.image.BufferedImage;

/*
* To change this template, choose Tools | Templates
* and open the template in the editor.
*/

/**
*
* @author Ameliya
*/
public class ModelProject {
private BufferedImage image;
private double summ;
private double M;
private double param;
private double D;

public ModelProject(Image img) {
image = (BufferedImage) img;
}

public void Matrix(){
Color[][] result = new Color[image.getHeight()][image.getWidth()];
int[][] redMatrix = new int[image.getHeight()][image.getWidth()];
int[][] greenMatrix = new int[image.getHeight()][image.getWidth()];
int[][] blueMatrix = new int[image.getHeight()][image.getWidth()];
double[][] grayScale = new double[image.getHeight()][image.getWidth()];
M = 0;
param = 0;

for (int i = 0; i < result.length; i++) {
for (int j = 0; j < result[i].length; j++) {
//i - высота
//j - ширина
result[i][j] = new Color(image.getRGB(j, i));
redMatrix[i][j] = (result[i][j]).getRed();
greenMatrix[i][j] = (result[i][j]).getGreen();
blueMatrix[i][j] = (result[i][j]).getBlue();
grayScale[i][j] = (0.299 * redMatrix[i][j] + 0.587 * greenMatrix[i][j] + 0.114 * blueMatrix[i][j]);
summ = summ + grayScale[i][j];
}
}
}