<JAVA_HOME>/bin/java.exe

А если серьёзно, то компиляция <> генерация исполняемого файла (.exe)
Если у тебя проект из 1000 файлов, то будет нехорошо генерировать исполняемый файл из этой тысячи, только чтобы проверить один исходник на наличие ошибок.

Что касается JDeveloper: если просто нужно запустить программу, ткни правой кнопкой мыши в Project Navigator на файл с методом main, и запускай (Run).

Если же нужно запускать из-вне, то тогда нужно более серьёзно изучать, как генерировать jar файл и как его запускать.