Зависит от системы, в которой ведутся эти справочники, технологии по которой они ведутся, а так же задач, для которых создается ХД.

В общем случае лучше сделать перекодировку, особенно для медленноменяющихся измерений. Т.к. в этом случае можно будет корректно отслеживать изменения отдельных атрибутов в значении элемента измерения. Например, предприятие может поменять название или форму собственности. В этом случае в источнике , скорее всего, будет выполнена операция обновления для уже существующего ID, а в ХД может быть выполнена операция вставки новой записи, с сохранением истории старого названия предприятия.

Это полезно сделать в том случае, если необходимо иметь возможность загружать и интегрировать данные из разных систем (даже если на данном этапе проекта такой интеграции нет, но в будущем она предполагается). Например, в случае если кодировка в разных источниках отличается. Тогда будет возможность хранить в перекодировочной таблице значения идентификаторов из разных источников и сопоставлять их с ID из ХД.

Если это суррогатные ключи и ХД будет использоваться только для анализа, при котором нет необходимости отслеживать медленноменяющиеся измерения, а так же существует только один источник, то можно использовать ИД из внешней системы.

Если это не суррогатный ID, а некий код, например, код ЖД станции либо ИНН, либо код из общероссийского классификатора продукции, то тогда однозначно надо делать перекодировку.