По умолчанию триггеры реплицируются как составная часть схемы: Table Articles Properties -> Snapshot -> User triggers -> Copy objects to destination. Если флажок разотметить, они публиковаться не будут. Очевидно, что если на издателе внести какие-л. изм-я в опр-е триггеров, они отреплицируются только вместе со следующим snapshot'ом.
Я не встречал к-л. подводных камней при репликации 6.х -> 7.0, причем последний может быть как подписчиком, так и дистрибьютором. Кстати, если впоследствии возникнет желание проапгрейдить 6.х до 7.0, имейте в виду, что документация предупреждает о следующих возможных caveats:
If the installation of SQL Server 6.5 already has replication enabled, the upgrade may fail if there are replicated transactions in the publishing database. You can determine the exact cause of failure by reviewing the text of the error message in Replication.err located in the specific directory for your upgrade

The schedules for replication tasks that are being upgraded are reset to the default schedule. After the upgrade process is finished, you should reset the desired schedule for each task.

You cannot upgrade replication settings directly from SQL Server 6.0 to SQL Server 7.0. You must first upgrade your installation to SQL Server 6.5.

Наск. я помню, 6.5 вообще не реплицирует identity, поэтому ставить на него not for replication бессмысленно. Возможны 2 выхода:
1) Апгрейдить 6.5-го дистрибьютора на 7.0. Скорее всего, издатель и дистрибьютор у Вас одно и то же, поэтому сказанное означает полный апргейд на 7.0.
2) Не апгрейдить 6.5. Тогда без разницы, кто у него подписчик, п.ч. все равно придется изгаляться. Перенести начальный snapshot на подписчика. Подправить на подписчике поле, поставив ему атрибут identity. Написать хранимую процедуру типа той, что приводится в Q190690 (смысл: включить identity_insert перед вставкой на подписчике и выключить после). Проассоциировать эту процедуру с применением транзакции типа insert на подписчике.

Если 7.0 у вас только подписчик (а кем он еще может быть при 6.5-м издателе?), то на нем not for replication не нужно тем более. Merge replication в случае 6.5 не работает.