Вероятно, кодировка базы master отличается от кодировки текущей базы, а запрос, генерируемый 1С включает обращение к системным табличкам или процедурам базы master. Скорее всего, не удасться вклинится в этот запрос, чтобы прописать там явное collation, как это рекомендуется в BOL, поэтому остается только одно: переставить сервер так, чтобы дефолтный collation совпадал с collation рабочей базы 1C. Естественно, эту версию надо проверить, сравнив кодировки баз и проанализировав запрос в профайлере.