В реляционной базе лучше реляционную модель использовать, как бы это глупо не звучало.
json вам может понадобиться если вам нужно будет хранить какой-нибудь объект с кучей пропертей и т.д. Причем лучше чтобы этот объект не менялся частями, иначе это приведет к созданию сложно в поддержке кода. Поэтому подходят только объекты которые сохраняются и зачитываются целиком .
Может быть где-то вам понадобиться получать данные в виде json, тут тоже можете сэкономить несколько десятков строк кода возвращая этот json сразу из базы.