Во вкладке "Зависимости" в контекстных меню для ХП и триггеров есть операция "Перекомпилировать все процедуры" и "Перекомпилировать все триггеры" соответственно. Добавьте такое же для PSQL-функций и пакетов, пожалуйста.
P.S. В зависимостях деревья UDF и PSQL-функций названы одинаково - "Функции" и отличаются только иконкой. Можно сделать, чтобы названия были разные?