АгаРазумеется книга покупок может быть сформирована в любое время, однако информация по НДС должна сохранится в момент выставления счета фактуры (лучше для этого использовать специальную таблицу - в ней хранятся данные по документу в разрезе как минимум ставок НДС, можно и номера ГТД добавить). Вот эта информация и является для основанием для формирования книги покупок/продаж.
У меня упорное дежавю, что Вы обсуждаете со мной Ваши фантазии. Я где-то писал, что книги не по НДС-у строятся, или данные из счетов-фактур не попадают в них, или НДС определяется на момент формирования книги? Рекомендую быть предельно точным в дефинициях, если хотите продолжать со мной осмысленную беседу.

АгаВо втором - при выставлении счета фактуры возникает нереализованный НДС. При сопоставлении оплаты и счета-фактуры (не позиций из нее!), нереализованный НДС закрывается (возможно частично) и формируется запись с реализованным НДС на сумму оплаты (если оплата закрывает счет) или счета (если счет закрывает оплату). Тут конечно возникает куча вопросов - если несколько ставок - какую закрывать в первую очередь? если оплата целиком не гасит счет - что в первую очередь гасить - НДС государству, задолженность клиента или пропорционально. Отвечаю - решается учетной политикой.
Отвечаю. Не решается. Платеж может быть частичный, на 2 конкретные позиции из 2 разных счетов. Дело не только в нескольких ставках. При последующих оплатах должна быть информация, что именно эти позиции уже оплатились.

АгаКстати вариант 2 до сих пор применим - почитайте Сергей про отложенное налоговое обязательство и зачет НДС.
То, что он применим, как и авансовые счета-фактуры фактически живее всех живых, я прекрасно знаю. Просто намекал на книгу покупок по оплатам, чтобы не кричали, что, мол, уже давно без оплат живем. Что такое "отложенное налоговое обязательство"? Это Вы про ПБУ 18/02? Не помню ссылок в НК на ПБУ 18/02.

АгаТак что Сергей возможно стоит пересмотреть свои подходы к учету НДС и не придется размазывать оплаты на позиции счета (и если система у Вас нормальная с финансовыми проводками и двойной записью - отщелкивать НДС по оплате с каждой позиции счета).
Собирать книгу по проводкам - тоже вариант. Только с моей точки зрения концептуально неверный, тем более если проводки формировать по счетам.