НДС... требует убрать корректирующие величины из товарных отчетов. Утверждает, что так не делается ...
Все правильно - так не делается.
НДС Может есть какие-то рекомендации, разъяснения или другие бумажки?
Учитывайте на складе товар в закупочных ценах. При этом НДС учитывайте отдельно. Т.е. в Таблице 3 колонки (к-во, сумма без НДС, НДС). Списание товара делайте по пропорции. При списании последнего количества списывайте весь суммовой остаток.

Если вы незнаете элементарных вещей то хоть бы почитали умных книжек. Хотя - зачем читать? Ведь можно спросить на форуме!..

НДС,

И еще. Кладовщику собственно на суммы плевать с высокой колокольни. Для него главное что б сошлось количество. А то по каким ценам отпускают со склада - это уже не его компетенция. Да хоть и за копейку пусть отдают. Так что меняйте что-то в вашем бардаке.

НДС,

На практике недостачу платят по цене продажи, т.к. владелец никогда непозволит себя обворовывать. А цена продажи может меняться, и даже были случаи что не 1 раз в день. Поэтому вы боретесь с ветряными мельницами. Если же уж очень хочется учитывать в ценах закупки то я вам помоему внятно разжевал как это делается. Если что-то непонятно - задавайте конкретный вопрос.
Насчет книжек. Пропорции это вроде как была математика за 5-й класс. По памяти уже и непомню. Насчет порядка учета НДС - смотрите законодательные акты и инструкции уточняющие порядок учета. У нас это Налоговый кодекс и инструкция Миндоходов. У вас может что-то другое. Но общие принципы основываются на базовых принципах. Различие может быть только в деталях (ставки налогов, сроки оплаты и т.п.).