Мммм... Насколько я понял, меняется метод расчета амортизации в целях налогового учета. Бухгалтерский не меняется.
Так что понадобится, имхо, либо изменять механизм отражения амортизации по БУ в НУ, либо написать отдельный механизм по амортизации ОС для НУ.

По сути этапы такие:
1. Создание возможности хранить в системе настройки налоговой амортизации для групп объектов
2. Создание возможности производить и хранить одиночные (бухгалтерская) и групповые (налоговая) расчеты по объектам/группам (бу/ну)
3. Генерация документов НУ и привязка (а вот к чему привязывать в БУ это вопрос)
4. Изменение отчетов

Вот в отчетах я не вижу большой проблемы. По сути в ведомостях убираются значения по строкам (по объектам ОС) и добавляются значения по группам (взамент того, что раньше было итоговыми значениями).

Сергей ВаскецовА ежели одновременно отчет по линейным и нелинейным ОСам строить? Есть же такие, типа оборотной ведомости?
Они регламентированные? Если нет, то самый простой путь - разбить на разные отчеты.
Или ввести разделы в отчете, если нужна одна простыня.