У всех компаний-внедренцев есть такие методики, но они являются коммерческой тайной и вряд-ли их можно найти.
Скорее всего, это придется делать самостоятельно. Кое какие вопросы внедрения освещены в статьях здесь: тЫнц
Так же, в качестве основополагающей идеи можно порекомендовать архитектуру системы по Захману (знаменитая матрица Захмана): тынЦ

Разве что вот еще нечто похожее - Microsoft Solution Framework (MSF): тыНц

Ну и вот, наверное, поможет: тынЦ

Мастер SQL
Обычно это(предпроектное обследование) делается как прийдется ;-) все завит от задач и целей обследования.

"Как придется" - неверная предпосылка. Это значит, что и вся последующая работа будет проделана "как придется".
Нужно четко понимать, какие вопросы должны быть заданы, зачем они должны быть заданы и как обработать и формализовать полученную информацию.
У нас на фирме существует собственная методика предпроектного обследования, которая в течение нескольких лет совершенствуется и развивается. Когда мы начинаем проект (как правило - это аналитическая система на базе Хранилища данных), то мы знаем, как действовать, чтобы преобразовать бизнес-требования в технические, технические - в задания разработчикам.
Т.е. методика - не есть догма, она развивается и пополняется с каждым проектом. Вот в этом - ее основная ценность, и именно поэтому она относится к категории непубличных документов.