На простой вопрос понаотвечали обо всём, что знали, но только не отвечали на вопрос.

В MS .NET есть компонент WF (Windows Workflow Foundation) для программирования и работы технологических процессов, частным случаем которых является СЭД. Имеется визуальный конструктор процессов в составе Microsoft Viasual Studio. Кроме того, в Sharepoint есть технологические процессы (сводящиеся к WF) и свой визуальный конструктор (правда, процессы в нём предусмотрены простые, но можно использовать и процессы WF). Таким образом, надо достать литературу по разработке процессов в WF и/или Sharepoint и ознакомиться. Готовые СЭД - я не знакомился (сам программирую в Документуме, то есть в другой технологии), но есть некая DocsVision, можно получить её демонстрационную версию. В ней также есть свой визуальный конструктор (в конечном счёте процесс выполняется в WF) и возможность использования подпроцессов и активностей процессов, спроектированных непосредственно в WF.
Причём тут C#: хотя с помощью визуальных конструкторов можно разработать целый процесс (или в WF можно, наоборот, целый процесс запрограммировать на C# без визуальных конструкторов), но есть смысл сочетать нарисованные и запрограммированные части процесса.
Для создания интерфейса пользователя используются различные технологии MS, в основном WebParts, тоже можно разрабатывать без программирования и с ним. Подробности - в документации по WF и Sharepoint. Есть много книг. На сайте MS есть кое-какие уроки.