Есть два способа указать параметры соединения с базой.
1. ключ /IBConnectionString (для базовых версий не используется) позволяет задать строку соединения с информационной базой целиком, в том виде в котором ее возвращает функция СтрокаСоединенияИнформационнойБазы(). Части строки соединения могут быть переопределены ранее существовавшими параметрами. Для этого нужно, что бы /IBConnectionString находился в командной строке раньше них. Передавая строку соединения в качестве параметра командной строки, нужно помнить о том, что строка соединения содержит кавычки. Поэтому требуется взять всю строку в кавычки, а содержащиеся внутри кавычки удвоить.


2. Через обычные ключи командной строки:
"c:\Program Files\1cv8\bin\1cv8.exe" Enterprise /S"server1c\Mybuh" /N"пользователь" /P"пароль"

А здесь - мешанина из двух стилей.
См. "руководство по установке и запуску" для 8.0 или встроенную справку по 8.1

исправление написанного:
"c:\Program Files\1cv8\bin\1cv8.exe" Enterprise /Sserver1c\Mybuh /Nпользователь /Pпароль