А ПО уже куплено? (Если нет то бюджет занижен раз десять)
В зависимости от того какое ПО куплено, можно подобрать сервер
Если версия SQL 2008R2 стандарт, то ограничение на память 64 Гб, т.е. на сервер не имеет смысла ставить больше 64-80 Гб оперативки
В зависимости от SQL CAL лицензий есть ограничения на колицество процессоров/ядер в сервере(
если лицензии на пользователя то нет ограничений, если процессорные то колицество процессоров не больше количества лицензий,
если еще не куплены (то по новой схеме лицезирования покупают лицензии на ядра, соответсвенно суммарное количество ядер не должно превышать количество лицензий).
Какая версия windows? (если 2008R2 стандарт то ограничение памяти 32 гб)

Насколько критичны простои? (т.е. нужно ли горячее резервирование блоков питания,теаминг сетевых карт)
В общем посоветовал бы Вам 1 сервер
96 Гб оперативки 40 т.р
2х сокетная материнка 20-25 т.р
корпус 30 т.р
1 проц 30 тр. (в будущем по необходимости поставите второй)
12 винтов 50 т.р
+ грамотная настройка всего этого.

Лучше 2 сервера (т.к. на сервере где крутится SQL лучше вообще ничего друго не держать), но т.к. бюджет у Вас очень маленький то второй сервер врятли выйдет (разве что задействовать предыдущий сервер).
А так как правильно подметил Злой Бобр лучше провести нагрузочное тестирование, чтобы выявить в чем затык.
Также важно грамотно настроить дисковую подсистему, т.к. 1с очень активно юзает временные таблицы.
Даже самый крутой сервер можно положить если к примеру поднять сервер на RAID 5 + поставить SQL сервер на виртуальную машину :-).