Если речь идёт о известно неактивной ФС, типа рутовой (всякие /var, /opt, прикладные ФС и т.п. - отдельно), то ufsdump вполне можно использовать и в мультиюзере.
Также, если используется зеркалирование, можно делать split-mirror backup любой удобной тулзой. Если используется vxvm, можно клонировать нужный раздел. Ну и ещё есть варианты. Выбор наиболее подходящего зависит от задач, требований и финансирования.

Есть рыба-пила и есть рыба-молот. Вот только не понятно, что они там строят...