Если речь идет о консоли

Можно посмотреть в сторону sed, например. Или awk, он чуть медленнее работает.

Из мануала tr Преобразование прописных в строчные:
$ cat MY.FILE | tr "[A-Z]" "[a-z]" > file.my
или
$ cat MY.FILE | tr "[:upper:]" "[:lower:]" > file.my
Обратно тоже умеет. Про кириллицу не скажу, не пользовался.

Файлы по имени или по маске с ограничение по глубине вложенности умеет находить find, она же умеет вызывать команду применительно к каждому найденному.

Из вот совсем-совсем готового это вряд ли. Однако, написать пару чуть ли не однострочных скриптов...