<Application x:Class="SettingsFileManager.App"
             xmlns="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml/presentation"
             xmlns:x="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml"
             xmlns:vm="clr-namespace:SettingsFileManager.ViewModel"
             xmlns:v="clr-namespace:SettingsFileManager.View">    
    <Application.Resources>
        <ResourceDictionary>
            <!--Класс унаследованный от Window-->
            <v:SettingsRecordWindow x:Key="nv"/>
        </ResourceDictionary>
    </Application.Resources>
</Application>

Window win = (Window) Application.Current.Resources["nv"];//В отладчике вижу, что количество ресурсов в приложении равно 0.
win.DataContext = this;

Window win = (Window) Application.Current.MainWindow.Resources["nv"];//В отладчике вижу, что количество ресурсов в приложении равно 0.
win.DataContext = this;