Уважаемые Господа, давайте жаб с лягушками не путать.

Маленький ликбез, если не возражаете.
Javascript - не жаба. Так, некий скриптец, упрощающий работу с HTML (точнее с DHTML). Хотя есть куча сайтов, которые его совсем не использують. Живет тольки в браузере на конкретной странице (фрейме).
Java - (java аплет, я имею ввиду) - это полноразмерное приложение, которое живет своей жизнью, хотя и зависит от браузера.

Без javascript тяжело, но жить можно. Он очень помогает, кады есть фреймы.
Jave на все фреймы наплевать - у нее свое окно (привязанное таки к конкретной странице или фрейму браузера).

Java используется редко из-за больщого гемора с совместимостью. Есть java от Sun, есть от мелкомягких. Плюс куча браузеров на разных OS. Вот хотя бы неполный список наиболее популярных

Netscape (Win, MacOS, Linux/Unix)
Mozilla (Win, Linux/Unix)
Mozilla Firefox (Win)
IE (Win, MacOS)
Camino (MacOS)
Safari (MacOS)

Во всем этом обезъяннике есть куча различий в интерпритировании простого HTML, не говоря уж о работе с JavaScript и Java. Самыми мерзкими по моему опыту являются IE под MacOS и Camino.

Java очень любят всякие игровые сайты.

Для того, чтобы работала Java - ее необходимо установить. Поэтому, иногда первым запускается JavaScript, который проверяет, установлена ли java и какой она версии.

Ну, вот, все кажисть, может чего и забыл...

Да, про вопросики то забыл...

Победный
все за и против использования жаб в разроботке.

см выше

Победный
Как защитить детище с жабой за пазухой от вариаций броузеров?

Большой гемор, тоесть большая работа. Надо написать свои классы работы с окнами, а потом реализовать их на более низком уровне для всех жаб/OS. Я про java говорю, не про JavaScript

Победный
Как вообще определить что на клиенте дохлая жаба?


Дохлую не определишь, а версию javascript может узнать. Кстати, JavaScriptу совсем не надо, чтоб на клиенте java стояла.

Победный
И еще один очень интересующий меня вопрос: Есть ли будущее у жабы или ее скоро вытеснить какой нить флэш?

Будушего у javы, как клиента нету (IMHO), как сервера - большое и щирокое. Для JavaScript все проше - теперь все браузеры стораются поддерживать его. Про флеш не знаю, думаю, что пока (год, два) будет развиватся, но до широкого применения не дойдет. Пока сложно на нем чо-либо ваять. А там видно будет.