Пешком по всему центру вдоль и поперёк.
От Карлова моста по улице наверх до Kostel sv. Mikulase (Церковь Святого Николая, но не которая в Старом Городе)
Далее не полениться и отправиться ещё дальше наверх до Страговской монастырской пивоварни. По дороге несколько сбоку есть Музей КГБ и Музей алхимии и магии (ни там, ни там не был, но может быть интересно).
От пивоварен вниз парком до фуникулёра и уже на нём совсем к берегу реки и пешком обратно в центр.

Там же в старом городе - Magic Garnet Granet Museum (интересно послушать, а то и прикупить чего).

Зоопарк (действительно круто). Ужин - U modre kachnicky II (надо заказывать место утром).

Хочется проникнуться и попробовать то, что едят чехи в обед сами (а не "для туристов") - V Kolkovne (наверное много подобных, но нам вот было рекомендовано такое).

Как ни удивительно, Zdenek's Oyster Bar.

PS По окрестностям там, вроде, ещё много интересного есть.

Barakuda-vas,

В Брюгге будет интересным сначала посмотреть In Bruges (если вам не претит жанр чёрной комедии) - отличные актёры, отличная игра и город фоном, я бы сказал, чуть не одним из главных персонажей.
Потом пройтись по "местам боевой славы" с приятными моментами узнавания.

Порекомендовал бы маленький частный отельчик в центре (~110 EUR за ночь).

Расскажите потом о впечатлениях! :)
Ну и опять же, чтобы "погрузиться", рекомендовал бы жить в центре.