Оно не теряется. Оно остается прежним, а колонки меняются.
Когда ты создаешь QueryTable оно по умолчанию создается с флагом "сохранять форматирование колонок". Это означает что:
При самом первом получении резалтсета, Эксель попытается догадаться какой тип у колонки резалтсета и соответсвенно установить форматирование колоноки на листе.
При втором и последующих запросах форматирование колонок на листе сохраняется неизменным даже если тип колонки резалтсета уже не соответствует предыдущему. Но при этом если в первом чтении резалтсета было пять колонок, а во втором чтении шесть колонок, то вот для этой шестой Эксель попытается опять угадать правильный формат.

Но если пойдешь в параметры QueryTable и снимешь флажок "сохранять форматирование" то Эксель всегда будет показывать резалтсет так как ты его видел в MSQuery.

Data -> Get External Data -> Data Range Properties