Наводящие вопросы:

1. Вы используете JDBC-пулы?
2. БД и контейнер сервлетов расположены на одной машине?
3. Вы используете Apache как frontend для обработки статического контента?
4. Вы формируете заголовок Last-Modified при отправке динамического контента?

Что бы ответить на Ваш вопрос для начала необходимо знать что именно Вы храните в базе (100тыс текстовых записей или 100тыс блобов по 100Кб?), какие именно SQL-запросы шлете и вообще возникали ли уже проблемы с быстродействием или это ни на чем не основанные страхи? В любом случае хорошо бы сначала потестить сайт (например: JMeter).

Dron81Спасибо за отзыв. Итак, по порядку:
1. JDBC-пулы не используются
2. машины с MySQL и Tomcat разнесены.
3. Нет, Apache не используется
4. Нет, заголовок Last-Modified не формирую.
Насчет структуры - никаких блобов и прочего тяжелого,
база скажем так занимает около 15-20 метров,
хранимый текст не в счет. SQL запросы не суперсложные.
Проблем пока не было, хочется просто соломки постелить:)
Прокоментируйте, плиз пункты 1,2,4 ,целесообразность их использования.

Пункт 1 - сделайте обязательно! это не сложно, при минимальных изменениях кода заметный выигрыш в производительности (готовый пул: DBCP )

Пункт 4 - желательно, так как при разумном использовании Last-Modified можно снизить трафик за счет кэширования страниц у клиента

Пункт 3 - сделать можно при возникновении проблем с производительностью (на коде никак не отразится). Apache/IIS будет обрабатывать статику (HTML, картинки и т. п.) за счет чего уменьшается нагрузка на контейнер сервлетов