....
void
Java_com_application_name_DataHelper_execUpper(JNIEnv* env, jobject obj, jstring s)

	char out[256] = { 0 };
	int rc, i;
	char query[256];
	sqlite3 *db;
	char * errmsg;
	char *sql[] = {"select upperCase(\"teSt\")"}; // запрос из java-кода получаемый через аргумент s

	rc = sqlite3_open("bd.sqlite", &db);

	sqlite3_create_function(db, "upperCase", 1, SQLITE_UTF8, 0, &upperCase, 0, 0 ); //регистрация функции
	sqlite3_exec(db, sql[0], callback, NULL, &errmsg); //выполнение sql запроса

    return;

}

static void upperCase(sqlite3_context* cx, int cnt, sqlite3_value** v)
{
	char * szDst = NULL;
	int    iDstLen = 0;
	const char* arg0 = (const char*)sqlite3_value_text( v[0] );
	utf8upstr(arg0, sizeof(arg0), &szDst, &iDstLen);*/
    	sqlite3_result_text( cx, szDst, utf8strlen(szDst), 0 );
	....
}

	....
        static native String upperCase();
	
	static {

        System.loadLibrary("UDF"); // сишный код моего враппера
        System.loadLibrary("sqlite");  //подключение sqlite - {sqlite3.h, sqlite3.c}
        ....
    }