У Jaybird, как и у других JDBC-драйверов есть несколько вариантов.
Ява-пюре (pure java или type 4) и "нативный" (native или type 2, если правильно помню спеку).
Тип четыре самодостаточен просто по определению.
Типу два, да - требуются клиентские библиотеки конкретной СУБД. Конкретно Jaybird 3+ взаимодействует с этими библиотеками через JNA, который "упакован" в драйвере. Jaybird 2.x использовал собственную JNI-прослойку.

P.S.
Тип выбирается строкой подключения. Это, конечно, если читать документацию как положено, а не по диагонали.
Ну и гитхаб, конечно, хорошо, но начинать лучше здесь .