забыл никno56892Для java IDEA. Единственно в чем выигрывает эклипс - дебаггером можно отлаживать несколько проектов одновременно (на одну JVM).

Это что правда? А что такое проект в идее? Ну допустим у меня есть слой контроллеров, назовем его UI, это отдельный модуль в эклипсе. Есть персистенс - там где доменные объекты. И что если я соберу варник, с двумя этими джарками, запущу томкат и законекчусь ремоут дебагом - я смогу дебажить или UI или персистенс но не все вместе?
Проект в идее - это папка в папке IdeaProjects. Как Вы описали - так получится (если делать модульный мавен проект), а вот если у вас 2 например вар файла и оба они используют общую jar, то, у Вас будет 2 независимых окна IDE, а соединение с ремоут дебаггером можно только одно устанавливать. Т.е. прийдется отконнекчиваться из одного и коннектится другим окном. Вот как-то так.

chpashano56892Проект в идее - это папка в папке IdeaProjects. Как Вы описали - так получится (если делать модульный мавен проект), а вот если у вас 2 например вар файла и оба они используют общую jar, то, у Вас будет 2 независимых окна IDE, а соединение с ремоут дебаггером можно только одно устанавливать. Т.е. прийдется отконнекчиваться из одного и коннектится другим окном. Вот как-то так.
я может не совсем понял суть проблемы, но дебажить можно и внешний jar, особенно если у него исходники имеются, можно и без них, но сними лучше. иметь все проекты в одном окне для этот не обязательно
Можно, то можно, только редактировать его там нельзя - это надо альттабиться в другое идеевское окно там выискивать и т.д.