DutchmanДоброго времени суток!

Возникла необходимость из бина формы отработать JavaScript код. В частности,
нужно отобразить модально окно, вызвав функцию alert(). Подскажите возможно
ли такое и если ДА, то как это сделать?

Что значит из бина вызвать яваскрипт? Этому должен предшествовать запрос, и если я правильно понял то что вы хотите сделать, никаких вебсокетов и комет тут не надо. Вам достаточно -
1) Допустим юзер кликнул линку
2) Вызвался метод бина на сервере
3) Этот бин выставил булевский флаг в тру
4) После вызова метода вы отрисовываете область страницы
<h:panelGroup rendered="#{yourflag}">
<script>alert()</script>
</h:panelGroup>

Таким образом выставив флаг на сервере вы выполните яваскрипт на клиенте.

Но если вам надо выполнить яваскрипт без клика на линку(и любого действия пользователя) - тогда да, комет вебсокет и тп

Погодите, давайте определимся.
Вам надо отрисовывать алерт после закрытия модального окна(действие пользователя) или в определенный момент времени, когда допустим новые данные пришли на сервер?

Dutchman... не знаю как правильно ответить, но ситуация следующая ... По закрытии пользователем
модального окна (по средством которого реализован поиск объектов), искомый объект передается в контекст страницы и страница перерисовывается (как я понимаю). На одном из гэтов компонента страницы (в частности rich:panelBarItem.label) реализован анализ полученного из контекста страницы искомого объекта. И если объект не удовлетворяет неким условиям (например, силовая подстанция не может быть подключена сама к себе), то необходимо вывести сообщение в виде Алерта ... вот как то так

А ну так все просто - комет вам не нужен.

На кнопку закрытия модального окна вешаете ajax-запрос на сервер - в вашей терминологии "искомый объект передается в контекст страницы". В этот момент вы можете определить все ли удовлетворяет вашим условиям и возвращаете некий результат. В функции oncomplete вы анализируете результат и показываете алерт или не показываете. В a4j:Button есть даже специальный атрибут data для таких случаев)