Здравствуйте! Прошу о помощи! Коротко о себе: новичок, с Linux знакомлюсь неделю, пока могу только работать по четким инструкциям с редкими отступлениями...
Пытаюсь выставить приложение по данной инструкции https://docs.openclinica.com/3.1/installation/installation-linux на AWS ec2 ос Ubuntu 10.04.4 LTS, на финише и ввожу команду запуска tomcat (инструкция): sudo /usr/local/tomcat/bin/startup.sh
получаю ответ: Neither the JAVA_HOME nor the JRE_HOME environment variable is defined
At least one of these environment variable is needed to run this program
Этот ответ очень сильно огорчает, так как уже проверял работоспособность приложения с данной ос и по данной инструкции на домашнем компьютере, повторил все команды на еще одном экземпляре сервера, пробовал вводить команды из серии: sudo JAVA_HOME=/usr/local/jdk1.6.0_2
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH, добавлять что то в startup.sh и другие файлы какие то строчки, но все четно. Возможно дело в том что я не проводил на удаленном сервере update и upgrade (в приветствии весит: 32 packages can be updated.
28 updates are security updates)...но наверное что другое... буду благодарен за любой совет ...

В меру своих знаний... Ваши комады:
ubuntu@ip-/////////////:~$ java -jar bin/bootstrap.jar
The program 'java' can be found in the following packages:
* gcj-4.4-jre-headless
* openjdk-6-jre-headless
* cacao
* gij-4.3
* jamvm
Try: sudo apt-get install <selected package>
ubuntu@ip-/////////////:~$ java -Dcatalina.home="/usr/local/tomcat" -jar "/usr/local/tomcat/bin/bootsrap.jar"
The program 'java' can be found in the following packages:
* gcj-4.4-jre-headless
* openjdk-6-jre-headless
* cacao
* gij-4.3
* jamvm
Try: sudo apt-get install <selected package>

Проблему с запуском tomcat разрешилась прописью в startup.sh строчки export JAVA_HOME=/usr . Спасибо Gkarthikeyan007. Но к сожалению, само приложение все равно почему то не работает и JAVA не видно в процессах((

Домашний пк:
user@ubuntu:~$ uname -a
Linux ubuntu 2.6.32-41-server #90-Ubuntu SMP Tue May 22 12:41:40 UTC 2012 x86_64 GNU/Linux (устанавливал ubuntu 10.04 lucid lynx)
user@ubuntu:~$ sudo /usr/local/tomcat/bin/startup.sh
[sudo] password for user:
Using CATALINA_BASE: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME: /usr
Using CLASSPATH: /usr/local/tomcat/bin/bootstrap.jar

Приложение доступно localhost:...

user@ubuntu:~$ sudo /usr/local/tomcat/bin/shutdown.sh
Using CATALINA_BASE: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME: /usr
Using CLASSPATH: /usr/local/tomcat/bin/bootstrap.jar
Сервер:
ubuntu@ip-10-228-25-157:~$ uname -a
Linux ip-10-228-25-157 2.6.32-345-ec2 #49-Ubuntu SMP Fri May 25 09:50:53 UTC 2012 i686 GNU/Linux (Другой экземпляр 64 и теже проблемы)
ubuntu@ip-\\\\\\\\\\\:~$ sudo /usr/local/tomcat/bin/startup.shUsing CATALINA_BASE: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME: /usr
Using CLASSPATH: /usr/local/tomcat/bin/bootstrap.jar

Приложение не доступно в папке /usr/local/tomcat/ должен появиться data файл, но этого не происходит.
При выключение tomcat выскакивает еще какая то ошибка.

ubuntu@ip-\\\\\\\\\\\:~$ sudo /usr/local/tomcat/bin/shutdown.sh
Using CATALINA_BASE: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME: /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME: /usr
Using CLASSPATH: /usr/local/tomcat/bin/bootstrap.jar
/usr/local/tomcat/bin/catalina.sh: 503: /usr/bin/java: not found

Ответы на дом. и удаленном пк идентичные кроме ошибки при отключение кота.

Вышеупомянутая мной инструкция (ссылка) по настройке приложения давала положительный результат на домашнем пк без всяких отступлений от нее. А на удаленном сервере такой радости нет. Может надо что то помимо java настраивать? Может дело в правах, подключение по ssh, юзерах (например sudo на удаленке использую без пароля) ограничениях и пр? Может попробовать экземпляр с другой ос?

Дистрибутивы стараюсь ставить стандартные, голые.
Опробовал сегодня новый ... все запустилось как домашнем, дата файл появился, но к сожалению, sudo links http localhost.... :status 404 description the requested resource is not available. В общем что то не везет мне... Буду искать решение теперь с этим. Большое спасибо тем, кто отозвался...пока не прощаюсь..