File f=ChooserFile.getSelectedFile();

f = C:\test.txt или
f = C:\test.doc или
f = C:\test.gif или
f = C:\test.bat

if (какую можно здесь написать проверку, чтобы проверять расширение файла????) 
{
             JOptionPane.showMessageDialog(null,"Запрещено загружать файлы кроме:\n" +
                    					       "doc,xls,docx,xlsx. \n"+
		                                               "Cохраните файл в режиме совместимости!", 
		                                               "Загрузка документа", JOptionPane.WARNING_MESSAGE); 
                    return false; 
}

 if (f.getName().substring(f.getName().indexOf("."),f.getName().length()).equalsIgnoreCase(".doc"))

select * from table where val not in ('doc','docx','xsl','xslx');