Удалось найти правильный способ прописать relation'ы в weblogic-cmp-rdbms.xml.
Но при попытке развернуть приложение он стал пишет:

Error: Exception activating module: EJBModule(survey-ejb.jar,status=PREPARED)
Unable to deploy EJB: SecondTestTableEJB from survey-ejb.jar:
[EJB:011020]The database table: second_test_table does not contain the columns: desc. Please consult your database mappings in the weblogic-cmp-rdbms.xml deployment descriptor and ensure these match your database schema.

Имена таблицы и колонок правильные, таблица и колонки существуют. Разве что таблица пустая, но разве это может иметь значение?