Правильно ли я понимаю, что Hibernate может быть использован в двух режимах:

1) Выступать в качестве чистой реализации JPA.
2) Реализовывать расширенный по сравнению с JPA функционал.

В первом случае используется файл конфигураци persistence.xml (где указываем провайдер), во втором hibernate.cfg.xml. Далее в первом случае используем entityManager, во втором sessionFactory. Ну и далее прочие отличия (например, для сохранения сущностей используется в одном случае persist() в другом save() - могу ошибаться, только начал разбираться) ...

В первом случае мы получим возможность сменить провайдера без изменения кода, так как выхода за пределы JPA не будет, а во втором случае получим более гибкий функционал? Поделитесь в двух словах, как это работает в реальных проектах? Какие best practice существуют в этом направлении?

В официальном доке по хиберу, много вставок типа (If JPA provider portability is important ...)

Не намного стало понятнее, хотя как спросил, так и ответили )

Ушел дальше хибернейт ковырять ...

ps. По поводу "конфигурирования портянками" - имеется виду не использовать xml в качестве конфигурационных файлов? А в чем преимуществто *.properties ? В xml один ситаксис, в properties - другой. Мы же вроде с ними напрямую не работаем, тот же hibernate сам все подтягивает?