SWT - построена на графических компонентах, предоставляемых ОС, т.е. обладает "native" (или "родным") интерфейсом системы. Отсюда вытекает необходимость реализации каждого компонента библиотеки для каждой отдельной платформы. Отсюда больше работы по портированию, устранению багов компонентов каждой ОС, например Windows.
Swing построена на каком-то базовом наборе функций. Т.е. компоненты вроде кнопки реализованы один раз, но для каждой платформы есть бызовый набор методов отрисовки графики, который нужно реализовать. Соответственно, интерфейс может быть лишь близок к родному для данной ОС. Но значительно проще портирование всей библиотеки.