wvetalИли стоит рассмотреть другие генераторы отчетов.

Это исключительно ваше личное дело.

wvetalВозможно ли сейчас запускать JasperReports в веб приложениях НЕ через Java Web Start или апплеты?

Это всегда было возможно.

Альтернативами для JasperReports можно считать Pentaho Open Reporting и BIRT.
У Pentaho Open Reporting по сравнению с JasperRreports есть недостатки: ограниченные скриптовые срества, не гарантировано с точностью до пиксела (pixel perfect) расположение визуальных элементов и медлительность при создании крупного отчёта (SQL запрос естественно выполняется с той же скоростью, но создание страниц медленнее, поскольку в Pentaho Open Reporting они интерпретируемые, а в JasperReports компилируемые). Преимущество - больше средств создания динамических отчётов. Также если нужен сложный анализ данных (business intelligence), то надо кроме самих генераторов отчётов рассмотреть относящиеся средства каждого из этих производителей, и у Pentaho они вроде более мощные. Но это надо самому сравнивать.
Ещё BIRT. У него я только проверил скорость работы для крупного отчёта - хорошая.
Впрочем, вспомнил ещё обстоятельство. У JasperReports можно ограничить объём памяти, потребляемый отчётом. Это полезно в ситуациях, когда на сервере приложений памяти может не хватать.