Для печати этикеток лучше использовать специальные принтеры. Печатая последовательно, по одной штуке, он позволяет сделать столько этикеток сколько надо. А с обычным принтером придется либо выбрасывать часть листа, либо делать специальную программку, которая будет рапределять этикетки на ширине листа в несколько строк и т.п. Либо запихивать в принтер обрезки бумаги - но это уже пошлость.
Я работал в Eltron, система команд у него не сложнее любого матричного принтера и принцип работы тоже как у матричного. На основе этих команд можешь запроста сделать форму для настройки параметров этикетики и печать на этикетке любого размера, и дать пользователю возможномть выбирать размер прямо на рабочем месте.
Eltron достаточно надежный. Самая существенная проблема, которая встречается, это когда пользователь криво оторвал ленту и ее затягивает в лентропротяжный механизм. Приходится разбирать принтер и вычищать изо всех щелей клей от этикетки.
Что касается сканера, то настройка префиксов, контрольных сумм и т.п. производится прямо на конкретном экземпляре. Вам просто надо определиться какие типы штрих-кодов сканер должен считывать.