В линуксе вообще полная **па с приложениями - приложение устанавливается только в те папки, в которые это задумано его автором, никакой гибкости, причём одно и то же приложение (например nginx) в одном дистрибутиве может быть установлено в /etc/nginx, в другом - куда-нибудь ещё, причём в первом свои данные оно будет хранить в /var/www, в другом - в /usr/www, в третьем - где-нибудь ещё. А самая мякотка в том, что узнать имена этих папок можно только их исходников или из гугла, т.к. чтобы посмотреть это в конфигах, надо знать где лежат сами конфиги, а они - см. выше.