MS SQL не подерживает запросы по запросам, это есть в Oracle, но не входит в стандарт SQL и, наверное, не поддерживается SQL для локальных баз.
То есть нельзя записать select anyfing from (select * from MyTable). Такой запрос обычно решается через временные таблицы.
Хотя нужно смотреть конкретную реализацию для Ваших форматов.

А в чем конкретно проблема? Какой формат баз? Может это по другому решается?