alex25ru,

Можно попытаться окончить его цикл обработки сообщений. PostQuitMessage попробовать (оно WM_QUIT шлет). Не факт, что поможет.
Это если из этого же потока, а если нет - то в лоб послать WM_QUIT нужному потоку. Вероятность, что сработает, еще меньше.

alex25ruПо WM_QUIT на msdn написано что, соообщение это нужно отправлять с помощью PostQuitMessage, но у него нету хэндла окна в качестве параметра.
При чем тут окно. Это сообщение потоку, чтобы он свой цикл обработки сообщений потушил, оно никакому окну не идет.
Попробуй в лоб, я ж говорю. Т.е. через PostThreadMessage. Для этого тебе ThreadId понадобится "того" потока. Это будет поток в процессе, который можно получить по GetWindowThreadProcessId.
Затем, с помощью этого PID, находишь все потоки процесса через CreateToolhelp32Snapshot и Thread32First/Next,
и для каждого потока делаешь EnumThreadWindows, пока не найдешь свое искомое окно.
Если нашел - значит именно этому потоку надо цикл обработки сообщений завершить.
Ему и шли WM_QUIT. Может сработать, хотя вероятность этого мала, и проверять мне, конечно же, лень.
Тем более, что сама задача - "Закрыть чужое приложение" - ставит под сомнение вообще её пользу (задачи).

alekcvp,

а, да, точно)