Не надо функции обрабатывать структуру неизвестного размера. Совместимость там обеспечивается в одну сторону - старая программа, которая не знает о добавленных в структуру полях, запускается на новой версии виндоуз. Функция видит, что размер структуры меньше, и использует для новых полей значения по умолчанию. В обратную сторону никто совместимость не обещал, и если программа передаст размер больше, чем ожидает винда, скорее всего функция вернет ошибку.