Ну например:
Твоя программа запросила: Введите количество студентов.
Юзер ввел: 3
Программа просит: А теперь введите оценки этих студентов.
Юзер вводит оценки для первого студента, для второго, для третьего, для четвертого, для пятого...
Вот в этом случае оценки для первых трех ты читаешь, а дальнейший ввод игнорируешь.
Устроит такое объяснение?

TulaStreetWhite Owl,

А как указать, после какой оценки допустим прекратить считывание?Это тебе решать.
Может там для каждого студента фиксированное число оценок (одна, две, десять) или ты будешь для каждого студента отдельно спрашивать сколько оценок для этого студента загрузить.

В любом случае. cin.ignore() нужен тогда, когда ты знаешь (или предполагаешь) что юзер чего-то печатает на клавиатуре, но тебе совсем не важно что именно он там печатает.