Ну почему нельзя? Можно.

MSDN
If the dwThreadId parameter is zero or specifies the identifier of a thread created by a different process , the lpfn parameter must point to a hook procedure in a dynamic-link library (DLL). Otherwise, lpfn can point to a hook procedure in the code associated with the current process.

В принципе два варианта. Можно вешать хук на поток какого-то окна (клавиатурный ввод ведь идет в окно). Тогда используешь GetWindowThreadProcessId например. Или можешь перебрать все потоки процесса и повесить хук на каждый. Тут можно использовать NtQuerySystemInformation, но это для больших любителей :)