Был у меня такой случай.
Писал на проекте JAVA/JSP + Oracle
пока девелопили на Oracle for WinNT все было пучком, когда запустили у заказчика на Linux Oracle началась беда.
В общем в результате все переписали в следующем виде:
try
{
тут обычно вызов хранимки и возврат результата в виде ResultSet
}
потом идем

finally
{
try
{
try
{
if (rs != null) { rs.close(); }
}
catch (Exception e)
{
}
finally
{
rs = null;
}

try
{
if (cst != null) { cst.close(); }
}
catch (Exception e)
{
}
finally
{
cst = null;
}
if ( conn != null ) conn.close();
}
После этого все стало нормально работать.