// сообщение, которое надо подписать содержится в файле dataToSignFile
hFile1 = ::CreateFile (dataToSignFile, GENERIC_READ,  0 , NULL, OPEN_EXISTING, FILE_ATTRIBUTE_NORMAL, NULL);

// читаем файл в szBuf 
DWORD dwFileSize = ::GetFileSize (hFile1, NULL);
char* szBuf = static_cast<char*>(malloc(dwFileSize +  1 ));
ZeroMemory(szBuf, dwFileSize +  1 );
ReadFile (hFile1, szBuf, dwFileSize, &dwRWBytes, NULL);

// получаем размер подписи
DWORD count =  0 ;
CryptHashData (hHash, (BYTE *)&szBuf[ 0 ], dwFileSize,  0 );
CryptSignHash(hHash, AT_SIGNATURE, NULL,  0 , NULL, &count);
CryptDestroyHash (hHash);

// подписываем сообщение szBuf 
// и записываем подпись в файл hFile2
hFile2 = ::CreateFile (resFile, GENERIC_WRITE,  0 , NULL, CREATE_ALWAYS, FILE_ATTRIBUTE_NORMAL, NULL);
char* sign_hash = static_cast<char*>(malloc(count +  1 ));
ZeroMemory(sign_hash, count +  1 );
CryptCreateHash (hCryptProv, CALG_MD5,  0 ,  0 , &hHash);
CryptHashData (hHash, (BYTE *)&szBuf[ 0 ], dwFileSize,  0 );
CryptSignHash(hHash, AT_SIGNATURE, NULL,  0 , (BYTE*)&sign_hash[ 0 ], &count);
DWORD dwRWBytes2 =  0 ;
WriteFile (hFile2, sign_hash, count, &dwRWBytes2, NULL);
CloseHandle (hFile2);

// подписали - все закрываем
CloseHandle (hFile1);
CryptDestroyHash (hHash);

bRes = CryptAcquireContext (&hCryptProv, NULL, MS_ENHANCED_PROV, PROV_RSA_FULL,  0 );
if (!bRes) {
   bRes = CryptAcquireContext (&hCryptProv, NULL, MS_ENHANCED_PROV, PROV_RSA_FULL, CRYPT_NEWKEYSET);
}
// Load public key
...
// Import public key
...
// Create hash
CryptCreateHash (hCryptProv, CALG_MD5,  0 ,  0 , &hHash);

CryptGenKey (hCryptProv, AT_KEYEXCHANGE, dwKeyLen | CRYPT_EXPORTABLE, &hPPKey);
 

CryptGenKey (hCryptProv, AT_SIGNATURE, dwKeyLen | CRYPT_EXPORTABLE, &hPPKey);