Почему бы и нет?

//получаем метку текущего времени
$now = time();
//коннект к базе
$conn = sqlite_open("database.db");
//выбираем дату из нужной таблицы
$time = sqlite_column(sqlite_query($conn, "SELECT time FROM table;"), 0);
//преобразуем ее в формат Unix Timestamp
$time = strtotime($time);

//если текущее время больше
if($now > $time) { //удаляем }

хотя это зависит от того в каком виде храниться дата в БД