Wild-Jack,
Слово репозиторий не существует, это хранилище. Слово трансформация существует, но применено неправильно. Это преобразование. Слово джоб не существует. Это задание. Слово степ не существует. Не буду уж подсказывать, как это по-русску.

Причина торможения непонятна. Я хоть и использую PDI с PostgreSQL, такого не видел. Может быть, и в PostgreSQL, хотя само по себе PostgreSQL не замедляется. Проверить, нормально ли оно работает без учёта PDI.

В Pentaho - проверить, произведена ли его настройка для хранения его объектов в PostgreSQL вместо применяемой по умолчанию HSQDB.