Любая БД предназначена для хранения данных, и соответственно, в БД прописываются правила хранения и взаимосвязи между данными. Т е - правило записанное один раз остается в БД(если его не удалять) и данные соответственно будут контролироваться этим правилом. Т е конечному пользователю в итоге менеджер БД не даст внести некорректные данные или удалить что-либо неправильно(не нарушая правил) - хоть ручками, хоть внешним приложением. Сответственно, неправильное проектирование БД может приводить к замедлению, причем очень существенному, работы БД. Если же вы эти правила реализуеьте внешними средствами, а БД будете использовать как набор невзаимосвязанных таблиц, это может привести к появлению "неправильных" с логической точки зрения данных, т к писать внешние модули без ошибок не получится, да и исправить данные в таблицах ручками не составит труда, правил-то нет. А отсюда, к примеру, ссылка на справочник с несуществующим кодом товара или что-то подобное.