Родные утилиты и системный планировщик решают большинство задач. Обслуживание базы, обновление справочников и проч. можно сделать с помощью одной лишь psql. Соответственно, и запустить их можно чем угодно, в том числе программно. Именно для этих целей даже библиотек никаких не нужно. Для других целей библиотеки выбирайте сами. Я предпочитаю родную libpq или odbc api (родной odbc-драйвер тоже использует libpq) в зависимости от условий.