Форма DROP COLUMN не удаляет столбец физически, а просто делает его невидимым для операций SQL. При последующих операциях добавления или изменения в этот столбец будет записываться значение NULL. Таким образом, удаление столбца выполняется быстро, но при этом размер таблицы на диске не уменьшается, так как пространство, занимаемое удалённым столбцом, не высвобождается. Это пространство будет освобождено со временем, по мере изменения существующих строк. (При удалении системного столбца oid это поведение не наблюдается, так как немедленно выполняется перезапись таблицы.)

Чтобы принудительно высвободить пространство, занимаемое столбцом, который был удалён, можно выполнить одну из форм ALTER TABLE, производящих перезапись всей таблицы. В результате все строки будут воссозданы так, что в удалённом столбце будет содержаться NULL.

--Создаю пустую таблицу
create table test();

--Добавляю 1600 столбцов
do
$$
declare
	rec record;
begin
	for rec in(select generate_series(1,1600) as num)
	loop
		raise info '%',rec.num;
		execute 'alter table test add c'||rec.num||' integer';
	end loop;
end$$;

--Удаляю 3 столбца
alter table test drop c1;
alter table test drop c2;
alter table test drop c3;

--делаю 
vacuum(full) test;
truncate table test;

alter table test add t1 text;
ERROR:  tables can have at most 1600 columns