Я по Apex 4.0 делал.
1. Создал скрытый айтем P1_TREE
2. В регионе дерева в свойстве Selected Node Page Item выбирал P1_TREE
3. Создал айтем TextField P1_SEARCH
4. Для P1_TREE устанавливал значение с помощью SQL запроса
SELECT ID FROM TABLE WHERE NAME LIKE '%'||UPPER(:P1_SEARCH||'%'
ID идентификатор таблицы, на основе которой создано дерево.
TABLE имя таблицы.
NAME поле таблицы - имена узлов дерева
5. Создал DA при изменении P1_TREE выполняется сабмит P1_TREE

В текстовое поле вводится имя узла, после нажатия ENTER айтему P1_TREE присваивается значение, DA делает сабмит, после перезагрузки страницы выделяется узел дерева с ID определенным с помощью SQL запроса.
Примерно так.